Equipe 2 : Epidémiologie clinique des maladies virales chroniques

Responsable(s) :
  • Fabrice CARRAT @ : fabrice.carrat at iplesp.upmc.fr

Presentation de l'équipe

L’équipe CLEPIVIR rassemble des composants de U1136 impliqués dans l’épidémiologie clinique des maladies virales chroniques. Les chercheurs coordonnent les principales cohortes thématiques de personnes vivant avec le VIH, les hépatites virales chroniques C, B et Delta et les co-infections. Ils développent et utilisent également des méthodes statistiques spécifiques pour estimer l'effet du traitement à partir de données d'observation.


Le VIH, l'hépatite virale et les coïnfections partagent des problématiques de santé publique et clinique similaires liés à la quantification des bénéfices, des risques et du coût efficacité des antiviraux à long terme et à l'évaluation du risque de comorbidités - notamment les cancers, les complications cardiovasculaires ou métaboliques, et les stratégies pour les prévenir. Nous rassemblons dans notre équipe parmi les plus grandes études de cohorte sur ces infections dans le monde. 


L'un de nos principaux engagements consiste à fournir aux autorités nationales de la santé des données sur les soins (y compris l'accès aux antiviraux, leur utilisation, leur coût, leur efficacité et leur sécurité) au niveau national afin d'orienter la politique de santé publique concernant ces infections chroniques.


Nous décrivons ci-dessous les principaux projets.


- Vivre avec le VIH: efficacité des stratégies pronostiques et thérapeutiques à long terme


La cohorte CO4 FHDH-ANRS est une cohorte ouverte multicentrique hospitalière avec inclusion continue depuis 1989. Les patients sont éligibles s'ils sont infectés par le VIH1 ou le VIH2 et sont pris en charge dans un centre participant. La base de données comprend des données provenant de 125 hôpitaux correspondant à plus de 153 000 patients examinés au moins une fois entre 1992 et 2015, et couvre plus de 60% des patients pris en charge en France. Les projets de recherche sont principalement axés sur le plus gros avantage de la base de données, sa taille. Nous étudierons les effets à long terme du traitement antirétroviral et le risque de comorbidités (cancer, maladies cardiovasculaires) associés au vieillissement, décrivons l'épidémiologie de l'infection par le VIH chez les patients hospitalisés en France. La base de données est également utilisée pour évaluer l’impact des médicaments antirétroviraux en santé publique. Des contrats sont régulièrement passés avec trois partenaires (INSERM, INSERM Transfert, société pharmaceutique) pour évaluer l’utilisation, l’impact et la rentabilité des nouveaux médicaments mis à disposition.


- Hépatite virale. Quantifier les avantages cliniques et les risques du traitement avec des antiviraux à action directe dans le traitement de l'hépatite C chronique; identifier les facteurs associés à une guérison fonctionnelle de l'hépatite B chronique


La cohorte ANRS CO22 HEPATHER est une étude observationnelle multicentrique nationale de sujets atteints d'hépatite virale B passée ou présente (> 6 000) ou C (> 14 000). La cohorte a été créée en août 2012, est parrainée et soutenue par l’ANRS-INSERM, a reçu un financement ANR-EQUIPEX et bénéficie d’un soutien des firmes pharmaceutiques. L'objectif principal de la cohorte est d'évaluer l'efficacité clinique et l'innocuité de ces nouveaux traitements et d'identifier ceux qui amélioreront le plus la santé globale. La cohorte comprend une biobanque centralisée à l’entrée de la cohorte et un lien individuel avec le système national des données de santé. Voir (WEBLINK) pour plus de détails. Nous étudierons l'impact d'une réponse virologique soutenue sur les comorbidités, notamment les maladies cardiovasculaires ou le risque de cancer. En ce qui concerne l’hépatite B, une partie de nos recherches porte sur l'identification des déterminants de la perte d’antigène HBs, considérée comme une cure fonctionnelle.


- Co-infection: interaction entre le VIH et l'hépatite virale, questions thérapeutiques et de santé publique


De nouveaux marqueursde l’hépatite B (tels l’antigène du « core » ou l’ARN du VHB) sont étudiés chez les patients mono infectés par le VHB pour leur capacité à prédire la perte d'antigène HBs, la fibrose du foie et carcinome hépatocellulaire. Chez les patients co-infectés par le VIH et le VHB, ces marqueurs ont des implications étroites sur le système immunitaire et la réplication du VIH, remettant en question leur capacité à prédire la perte d’AgHBs et la gravité de la maladie. Ces questions seront abordées au sein de la cohorte multicentrique française VIH-VHB coordonnée dans l’équipe.


La deuxième partie de notre investissement dans l’hépatite virale et la co-infection VIH concerne l’identification des meilleures stratégies de dépistage et de traitement de l’hépatite virale dans les pays à ressources limitées avec des projets « pilotes » au Cameroun et en Côte d’Ivoire.


- Méthodes Mesures de l'effet du traitement dans les études d'observation


Nos recherches sur ce thème seront principalement axées sur l'évaluation et la comparaison de différentes approches statistiques en matière d'inférence causale de l'effet du traitement à partir de données d'observation. Parmi différents sujets, nous allons :


• comparer les performances de divers modèles alternatifs permettant de lier l'exposition au médicament en termes de durée / dose cumulée avec un effet bénéfique ou indésirable ;


• comparer les estimations MSM et G des modèles structurels imbriqués en introduisant la résistance comme modification de l'effet afin de valider l'algorithme génotypique de résistance aux médicaments du VIH1 (collaboration avec l'équipe3) ;


• comparer différentes mesures des effets du traitement lorsque l’on suppose que l’hypothèse des risques proportionnels (PH) n’est pas valable ;


• explorer des méthodes pour combiner en une seule base de données des informations pertinentes provenant de plusieurs sources hétérogènes, afin d'accroître les capacités analytiques.


 

Membres de l'équipe

Nom Contact Statut / Fonction
Xian ABULIZI xian.abulizi at iplesp.upmc.fr Ingénieur d'Etude / Doctorant-e
Niswati AHAMADA niswati.ahamada at inserm.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Adel AMIROUCHE adel.amirouche at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Douae AMMOUR douae.ammour at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Khadija AMRANI khadija.taibi at aphp.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Maxime ANGOT maxime.angot at iplesp.upmc.fr Développeur
Lydie ANTOINE lydie.antoine at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Loubna AYOUR loubna.ayour at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Jessica AZZI jessica.azzi at iplesp.upmc.fr Stagiaire de Master
Aliou BALDE aliou.balde at iplesp.upmc.fr Etudiant-e / Doctorant-e
Elizabeth BELMONTE-ZALAR elizabeth.belmonte at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Jaouad BENHIDA jouad.benhida at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Djourhra BETRAOUI SI AHMED Attaché-e de Recherche Clinique
Fabienne CABY fabienne.caby at aphp.fr PHC
Thierry CALVEZ thierry.calvez at iplesp.umpc.fr CH contractuel
Fabrice CARRAT fabrice.carrat at iplesp.upmc.fr PU-PH
Frédéric CHAU frederic.chau at iplesp.upmc.fr Data manager, développeur Senior
Caroline CHEVALIER caroline.chevalier at chu-nantes.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Romuald CRUCHET romuald.cruchet at iplesp.upmc.fr Stagiaire de Master
Hafida DABARHI hafida.dabarhi at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Cécile DEBACQUE Attaché-e de Recherche Clinique
Manel DEBBA-PAVARD manel.debba-pavard at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Lorenza DEZANET lorenza.dezanet at iplesp.upmc.fr Post-Doctorant-e
Céline DORIVAL celine.dorival at iplesp.upmc.fr Chef de projet
Léa DUCHESNE lea.duchesne at iplesp.upmc.fr Doctorant-e
Simplice DZAMITIKA simplice.dzamitika at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche
Imane EL ATMANI imane.el-atmani at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Philippe FLANDRE philippe.flandre at iplesp.upmc.fr Chargé de Recherche
Sandrine FRANCOIS sandrine.francois at chu-limoges.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Léa GARESSUS lea.garessus at iplesp.upmc.fr ARC
Pierre-Marie GIRARD pierre-marie.girard at iplesp.upmc.fr PU-PH
Isabelle GODEREL isabelle.goderel at iplesp.upmc.fr TCH
Ophélia GODIN ophelia.godin at iplesp.upmc.fr Post-Doctorant-e
Héloïse GOIN heloise.goin at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Sophie GRABAR sophie.grabar at iplesp.upmc.fr MCU-PH
Marguerite GUIGUET marguerite.guiguet at iplesp.upmc.fr Chargé de Recherche
Warda HADI warda.hadi at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Céline HEROLD Attaché-e de Recherche Clinique
Meshak KAKUDJI meshak.kakudji at iplesp.upmc.fr Stagiaire de Master
Esma KARAYIGIT esma.karayigit at iplesp.upmc.fr ARC / Attaché-e de Recherche Clinique
Karine LACOMBE karine.lacombe at iplesp.upmc.fr MCU-PH
Anne LALIGANT anne.laligant at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Nathanael LAPIDUS nathanael.lapidus at iplesp.upmc.fr MCU-PH
Séverine LECLERCQ severine.leclercq at iplesp.upmc.fr Ingénieur d'Etude / Informaticien-ne
Amandine LEGENDRE amandine.legendre at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Hana LENEMAN hana.leneman at iplesp.upmc.fr Ingénieur d'Etude / Statisticien-ne
Laurence LIÈVRE laurence.lievre at iplesp.upmc.fr Ingénieur d'Etude / Informaticien-ne
Clovis LUSIVIKA clovis.lusivika at iplesp.upmc.fr Doctorant-e
Edouard MAHIEU edouard.mahieu at iplesp.upmc.fr Stagiaire de Master
Hugues MELLIEZ hugues.melliez at outlook.fr Praticien Hospitalier / Doctorant-e
Rym MONARD rym.monard-ext at aphp.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Priscilla MONFALET priscilla.monfalet at iplesp.upmc.fr Développeur
Kim Tu An NGO kim-tu-an.ngo at iplesp.upmc.fr ARC
Cherifa OUAZZI cherifa.ouazzi at inserm.fr Attaché-e de Recherche
Grégory PANNETIER gregory.pannetier at iplesp.upmc.fr TCH / Informaticien-ne
François PINOT francois.pinot at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Chloé POMES chloe.pomes at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Valérie POTARD valerie.potard at iplesp.upmc.fr Statisticien-ne
Hélène ROUL helene.roul at iplesp.upmc.fr Ingénieur d'Etude / Data manager
Odile STAHL odile.stahl at iplesp.upmc.fr Biostatiticien-ne
François TEOULE francois.teoule at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique
Florence TREBALAG florence.trebalag at iplesp.upmc.fr Développeur
Thomas VERGER thomas.verger at iplesp.upmc.fr Attaché-e de Recherche Clinique